近藤 寛子 Kondo Hiroko X.

研究者情報
所属 地域未来デザイン工学科 - バイオ食品工学コース
メールアドレス h_kondo@mail.kitami-it.ac.jp
学位・学歴・職歴

学位

博士(科学) 2012

職歴

2019年4月- 北見工業大学 工学部 地域未来デザイン工学科 助教
2018年3月- 広島市立大学大学院 情報科学研究科 客員研究員
2013年4月- 理化学研究所 生命機能科学研究センター 客員研究員
2018年3月-2019年3月 北見工業大学 工学部 地域未来デザイン工学科 特任助教
2015年4月-2018年2月 広島市立大学大学院 情報科学研究科 特任助教
2013年4月-2015年3月 東北大学大学院 情報科学研究科 博士研究員
2013年1月-2013年3月 理化学研究所 生命システム研究センター 特別研究員
2009年4月-2012年3月 理化学研究所 ジュニア・リサーチ・アソシエイト
担当科目・専門分野等
担当授業科目(学部)
地域未来デザイン工学入門, バイオ食品工学概論/短期履修, ゼミナール バイオ
専門分野
生物物理学,分子動力学シミュレーション
所属学会
日本生物物理学会, Biophysical Society, 日本蛋白質科学会
著書
タイトル/出版社等
光るクラゲがノーベル賞をとった理由―蛍光タンパク質GFPの発見物語
日本評論社, 2009-04
学術論文等

学術論文

論文名/掲載誌名等   掲載年月
Free-energy landscapes of protein domain movements upon ligand binding
The Journal of Physical Chemistry B, 115, 23, 7629
2011-06
Structural basis for the membrane association of ankyrinG via palmitoylation
Scientific Reports, 6, 23981
2016-04
The evolutionary process of mammalian sex determination genes focusing on marsupial SRYs
BMC Evolutionary Biology, 18, 3
2018-01
Zn2+-Binding to the Voltage-Gated Proton Channel Hv1/VSOP
The Journal of Physical Chemistry B, 122, 39, 9076-9080
2018-09
Statistical and quantum-chemical analysis of the effect of heme porphyrin distortion in heme proteins: Differences between oxidoreductases and oxygen carrier proteins
Chemical Physics Letters, 710, 108-112
2018-10
Molecular mechanism of depolarization-dependent inactivation in W366F mutant of Kv1.2
The Journal of Physical Chemistry B, 122, 48, 10825
2018-11
Hydrogen bond donors and acceptors are generally depolarized in α-helices as revealed by a molecular tailoring approach
Journal of Computational Chemistry, 40, 23, 2043-2052
2019-05

参考論文

論文名/掲載誌名等 掲載年月
アンキリンが生体膜に相互作用する構造基盤
生物物理, 58, 3, 152-154
2018-05

講演発表

発表題名 発表年月
電位依存性プロトンチャネルVSOP における亜鉛イオンの役割についての計算機シミュレーション
第15回日本蛋白質科学会年会, 徳島
2015-06
Molecular dynamics simulations of the effect of zinc on the voltage-gated proton channel VSOP
第53回日本生物物理学会年会 , 金沢
2015-09
電位依存性プロトンチャネルVSOP における亜鉛イオンの影響
第29回分子シミュレーション討論会, 新潟
2015-12
電位依存性プロトンチャネルVSOPに対する亜鉛の影響の解析
大阪大学蛋白質研究所セミナー「構造を基盤とする蛋白質科学の未解決問題」, 東京
2016-03
分子動力学シミュレーションによるイオンチャネル変異体の解析
第1回イオンチャネル研究会, 福岡
2016-07
分子動力学シミュレーションを用いた脂質二重膜内におけるPI(4,5)P2の安定性の解析
第16回日本蛋白質科学会年会, 福岡
2016-09
分子動力学シミュレーションによる抗HIV中和抗体PG16のCDR-H3における構造剛性の解析
第54回日本生物物理学会大会, つくば
2016-11
電位依存性プロトンチャネルVSOP/Hv1における亜鉛イオンの結合様式の解析
第54回日本生物物理学会大会, つくば
2016-11
脂質二重膜におけるPI(4,5)P2 の安定性の解析
第30回分子シミュレーション討論会, 吹田
2016-12
A study of dynamics of palmitoylated Ankyrin-G around a lipid bilayer by coarse-grained simulations
第94回日本生理学会大会, 浜松
2017-03
電位依存性カリウムイオンチャネル変異体のシミュレーション および 統計手法を用いたミクロ構造解析
第17回日本蛋白質科学会年会, 仙台
2017-06
ヘムの構造の統計的解析とDB化
計算タンパク質科学研究会, 箱根
2017-08
Molecular dynamics study of kinetics of the voltage-gated proton channel VSOP/Hv1 under electric fields
第55回日本生物物理学会年会, 熊本
2017-09
電位依存性カリウムチャネル変異体の電位依存的な構造変化の解析
第31回分子シミュレーション討論会, 金沢
2017-11
電位依存性カリウムチャネル変異体の電位依存的な不活性化機構の解析
第18回日本蛋白質科学会年会, 新潟
2018-06
電位依存性カリウムチャネル変異体の不活性化機構の解析
第3回イオンチャネル研究会, 福井
2018-07
構造機能相関解析に向けたヘムタンパク質のデータベースの構築
第67回高分子討論会, 札幌
2018-09
Global analysis of the protein environment around heme in hemeproteins
第56回日本生物物理学会年会, 岡山
2018-09
Molecular mechanism of voltage-dependent inactivation on W366F mutant of Kv1.2
CCS international symposium 2018, Tsukuba
2018-10
αヘリックス構造における相互作用エネルギーの理論解析
第32回分子シミュレーション討論会, つくば
2018-11
αヘリックス構造における水素結合エネルギーの理論解析
計算タンパク質科学研究会, 千歳
2018-11
Molecular dynamics study on the mechanism of voltage dependent inactivation in a mutant of the voltage-gated potassium channel
Asian Biophysics Association Symposium and Annual Meeting of the Australian Society for Biophysics, Melbourne, Australia
2018-12
電位依存性カリウムチャネル Kv1.2 における C 型不活性化の分子機構の解析
凝縮系の理論化学, 石垣
2019-03
Molecular dynamics study on the mechanism of inactivation in a mutant of the voltage-gated potassium channel Kv1.2
63rd Annual Meeting of the Biophysical Society, Baltimore
2019-03
受賞
2009 Bioinfo 2009 CBI-KSBSB Joint Conference Best Poster Award
2009 研究科長賞(修士)
2008 バイオスーパーコンピューティングシンポジウム2008 ポスター賞
2008 第22回分子シミュレーション討論会 学生優秀発表賞
2007 The 27th anniversary international CBI conference Award for the excellent poster